Selain akademik, SDIT Ibnu Hajar Kota Batu juga menekankan pembelajaran berbasis karakter dalam kegiatan intrakurikuler. Nilai kejujuran, disiplin, tanggung jawab, dan kerja sama ditanamkan dalam setiap aktivitas kelas.

Guru membiasakan siswa untuk bersikap santun, menghargai teman, serta bertanggung jawab terhadap tugas yang diberikan. Pembiasaan ini dilakukan secara konsisten agar menjadi karakter yang melekat pada diri siswa.

Melalui pembelajaran berbasis karakter, sekolah berharap dapat membentuk siswa yang tidak hanya cerdas, tetapi juga berakhlak mulia.